Biología Molecular

Es un laboratorio de investigación que forma parte del CIBE, y está dedicado al estudio de importantes procesos biológicos a nivel molecular, genética y genómica funcional, con el objetivo de generar conocimiento que podría aportar a la solución de distintas problemáticas del sector agrícola.

La generación y ejecución de proyectos de investigación nos ha brindado la oportunidad de captar múltiples fuentes de financiamiento, tanto nacionales como internacionales, lo que ha permitido nuestro desarrollo y que a la vez seamos capaces de servir como plataforma a diferentes áreas del centro. Además nos hemos abierto espacios en los que podemos ofrecer servicios a la comunidad y capacitaciones profesionales que nos permiten generar recursos propios como fuente adicional de financiamiento.

Contamos con la infraestructura y el personal necesario para el desarrollo de una gran variedad de técnicas, tales como la determinación de Organismos Genéticamente Modificados (OGMs), separación de proteínas en geles bidimensionales, generación de librerías genéticas, caracterización genética de organismos, ingeniería genética vegetal, análisis de expresión génica, entre otras, lo que nos permite identificarnos como un laboratorio de primer nivel en el Ecuador.

Lineas de investigación:

  • Transformación genética de diferentes cultivares de banano, arabidopsis, tabaco y arroz mediante Agrobacterium tumefaciens para resistencia a estrés biótico y abiótico. Caracterización de promotores con genes reporteros LUC, GFP, GUS.
  • Identificación de genes candidatos a resistencia a Sigatoka negra y expresados mediante la aplicación foliar de biofertilizante líquido, utilizando la técnica hibridación substractiva por supresión y secuenciación de siguiente generación.
  • Biofortificación mediante Ingeniería Genética para el aumento de ácido fólico en Musa spp.
  • Detección de organismos genéticamente modificados (OGM) en alimentos y cultivos.

Proyectos:

  • VLIR-RIP: Folate Biofortification of Banana Musa spp., 09/2014-08/2017. Director: Ph.D. Efrén Santos.
  • Next-generation sequencing for deep transcriptomic analysis of a tropical plant-fungus interaction (NEGENTROP), 08/2011-11/2015. Director contra parte Ecuador: Ph.D. Efrén Santos.
  • Identificación de genes sobre-expresados por la aplicación de biol en plantas. Director: Ph.D. Efrén Santos.
  • Detección de organismos genéticamente modificados mediante técnicas de PCR. Director: Ph.D. Efrén Santos.
  • “Implementación de métodos biotecnológicos en mejora genética de banano (Musa spp.) para resistencia a Sigatoka negra (Mycosphaerella fijiensis)”, 10/2008-07/2011. Director: Ph.D. Efrén Santos.

Publicaciones:

  • Sánchez Timm E, Hidalgo Pardo L, , Chávez Navarrete T, Navarrete Villegas O, Santos Ordóñez E (2016) Identification of Differentially-Expressed Genes in Response to Mycosphaerella fijiensis in the Resistant Musa Accession ‘Calcutta-4’ Using Suppression Subtractive Hybridization. PLoS ONE 11(8): e0160083. doi: 10.1371/journal.pone.0160083
  • E. Santos, E. Sánchez, L. Hidalgo, T. Chávez, L. Villao, R. Pacheco, J. Flores, S. Korneva, O. Navarrete. Advances in Banana Transformation through Agrobacterium tumefaciens in Ecuador: Progress, Challenges and Perspectives. International Society for Horticultural Science, Acta Horticulturae IHC2014: “Unravelling the banana’s genomic potential”.
  • Santos E., Sánchez E., Hidalgo L., Chávez T., Villao L., Navarrete O. Status and Challenges of Genetically Modified Crops and Food in Ecuador. Acta Horticulturae.
  • Santos E., Pacheco R, Villao L, Galarza L, Ochoa D, Jordán C, Flores J. (2016). Promoter analysis in Banana. In:  Banana: Genomics and transgenic developments for crop Improvement. S. Mohandas and K. V. Ravishankar Eds. Springer. 157-179 p.
  • Galarza L., Akagi Y., Takao K., Sun Kim Ch., Maekawa N., Itai A., Peralta E., Santos E., Kodama M. 2015. Characterization of Trichoderma species isolated in Ecuador and their antagonistic activities against phytopathogenic fungi from Ecuador and Japan. J Gen Plant Pathol 81(3) 201-210.
  • Galarza L., Akagi Y., Takao K., Peralta E., Santos E., Kodama M. 2015. Involvement of ThSNF1 in the development and virulence of biocontrol agent Trichoderma harzianum. J Gen Plant Pathol 81(3) 211-217.
  • Korneva S., Flores J., Santos E., Piña F., Mendoza, J. 2013 Plant regeneration of plantain ‘Barraganete’ from somatic embryos using a temporary immersion system. Biotecnol Apl, vol.30, no.4
  • Manzano P., Miranda M., Gutiérrez Y., Santos E., Scull R. 2014. Estudio morfo-anatómico y genético de Vernonanthura patens. J Pharm Pharmacogn Res 2(5): 119-128.
  • Santos E. 2014 Bananos Genéticamente Modificados en el Ecuador: Desarrollo y Análisis de Riesgo. Factor sostenible: Biotecnología Moderna, p: 26-28.

Cursos ofrecidos por el área:

  • Curso teórico-práctico de Transformación genética en plantas: usos y aplicaciones de genes reporteros GUS, GFP, LUC.
  • Curso teórico-práctico de PCR punto final y tiempo real.
  • Curso teórico prático de organismos geneticamente modificados.

 

 
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